浙江恒康藥業是國家認定企業技術中心，在臺州（三門）、杭州分別設有研究所，建有2個研發專用中試車間。研發中心以國際大型制藥公司研發中心為標準，設有20 套標準實驗室，擁有各種分析檢測設備，研發內容涵蓋化學藥物、生物藥物、制劑等多個方向。
        中心現有研發人員50 多人。中心與清華大學、浙江大學等國內知名院校和科研機構有著廣泛深入的合作。
        中心致力于新藥及制藥新技術的研究，每年投入大量的資金用于研究開發，構建了完善的研發創新體系和考核獎勵制度。近幾年來，公司每年研發項目達20余項，在產品開發和技術創新方面均取得了突出的成績，并得到了國家各級有關部門的肯定。在研發中心科研創新成果的基礎上，浙江三門恒康制藥有限公司于2017 年被認定國家高新技術企業。